与此同时,在海军舰队的帮助下,自琉球启程的两万一千海军陆战队渡过海峡直取建安郡,一路横扫东南沿海诸州郡,所过之处江东无不望风而降。
北地强大的攻势一下子震慑了江东各地豪强,本来还在吴县争论不休的王敦和江东本地世家顿时放弃争吵,两下合力准备全力抵抗北军南下,随后王敦正式统领顾、张、周、陆四家私兵组成的联军。
而朝廷大军渡江之后,刘琨坐镇建康先将建康城内地两万将东北给缴械整编,而后他又上书朝廷请求皇帝司马遹赶紧指派地方官员,前来接收江东各地。而就在这个时候,从北地传来前晋王司马睿上表朝廷辞去所有官职并传令扬、荆、广、湘、交诸州兵马原地待命不得异动的消息。
江东各地闻之大惊,除了少部分官员听从了司马睿的命令外,大多数人还是选择了负隅顽抗。十月十曰,刘琨在建康城中陆陆续续整顿好江东降兵之后,又从徐州、豫州两地征集了五万府兵,遣都尉石勇为前锋领军直下吴郡。
三曰后,厢军在刘琨的指挥下于阳羡大败王敦统领的叛军,斩首一万一千余,俘虏超过三万人,基本上消灭了叛军的主力部队。王敦领残部窜逃吴兴郡和会稽郡。而就在这时,大晋海军近海舰队第一分舰队汇集了五千水兵和一万陆战队一举收复了上虞、句章、余姚和山阴,直接端了王敦叛军的后路,接着又继续攻陷了永兴与早就接过防务的钱塘连成一片。
王敦见去路已断,只得转向再次逃往吴郡,都尉石勇领兵在后面紧追不舍。王敦逃到吴郡边境才发现,东路厢军已经从丹徒打了过来,没办法他只好朝着东边大海逃去,结果走到海边被守株待兔的陆战队给逮个正着。