眼见无路可逃，王敦仰天长叹，他转身看着身边仅余的数百亲兵，不由得怆然一笑，一把抽出宝剑自刎而死。旁边的亲兵看到王敦自杀，顿时就像没了魂魄一样，叮叮当当兵器掉了一地。
而顾荣、张尚、刁协等江东士子见厢军攻击犀利，他们只得调头南逃。当众人领着残军逃入临海郡的时候，突然被大海阻住去路。看到前无去路后有追兵江东世家突然发生内乱，顾家为了活命想要拿张家人头去赎罪。
谁知张尚也不是好惹的，他表面上装作不知，却暗中调集张家私兵着手反击。结果两家在大海边上打得死去活来，等到海军陆战队从建安郡杀到的时候，张、顾两家私兵已经不剩多少，就连两家直系子孙也战死不少。
而剩余的顾、张两家子孙全都厢军擒获并押到洛阳，等到洛阳之后传承数百年的顾家和张家随即被司马遹下旨诛族，两家剩余共五百余口全都被杀。当然了期间不时没有人为他们求情，但都被司马遹严词拒绝，如此朝廷上下再次感受到皇帝散发出来的凌厉杀气。
王敦自杀，顾、张两家被灭并不意味着江东就会安定下来，司马遹并没有就此罢手，他再次通过内阁昭告天下：宣布江东十几个世家大族为叛逆，要求他们赶紧向朝廷投降！并再次要求江东其余各地兵马立即停止对抗，就近向厢军各部投降，接受朝廷的指挥和整编。
与此同时，皇帝司马遹下旨调裴嶷等一干官员到扬州刺史和郡守，经此战乱扬州各地官员缺口甚多，不少县令和郡守在战乱中被杀。这次朝廷共抽调了数百名官员到扬州填补空缺，有了行政官员的支持，被收复的州郡很快就走上正轨。
在这场战乱当中，最惨的还是原本在江东势力强大的世家大族。一部分世家在王敦整顿期间被抄家灭族，剩下的或在战乱当中毁于战火，又或因参与到叛乱中被朝廷清算。凡参与叛乱的世家都逃不出灭顶之灾的结局，他们的族人被杀家产被没收族人尽数配边州。
