粪肥的加工工艺并不复杂，主要分为北方和南方粪肥。
北方粪肥的制作流程为：秋天把玉米秸杆切成小段，再按上下顺序呈经纬状堆为一垛，往上泼浇粪尿水，必须达到使其长时间的浸泡即发沤的效果，然后令其发酵，也可加入烧完后的富含钾肥的草木灰或木炭，到来年春季即会沤干成小块小块灰黑色的肥料或带有水质的灰黑色的肥料水，此即粪肥；亦可用麦草垛来制作粪肥。在粪肥制作过程中往秸杆垛里总会随时添加其他植物的茎、蔓、叶或打扫庭院所撮起的枯树枝条等。
南方粪肥的制作程序为：邑城与各圩镇，旧日由四郊农民于夜间挑桶进城，到各户收粪便，俗称“尿倒”。以单车挂桶搬运粪便，并逐步代替了担粪方式，主要是运输工具的改善。
此外，还有一种拾猪屎。
相比现代使用的化肥，粪肥对农作物不良影响很小，所以自古耕种田地必用粪肥，它包含人粪、鸡粪、猪粪、牛粪等等。
甄乾还知道一种方法，就是挖个大池子，把各种动物粪便连同一些秸杆、菜根等都扔进一个巨大的粪坑里，加入尿液、水等然后盖起来发酵，这类似于沼气池发酵，虽然发酵慢，但有机质消耗较少，渣肥和沼液都有很高的肥力，特别是沼液甚至还能充当杀虫剂使用。
这种方法都是极好的粪肥加工方法，能让粪肥转化效率更高，亩产量可以再翻倍。
