王化贞布署兵力根本就不向熊廷弼请示，你经略大人不是主张防吗？我偏要攻。气得熊廷弼不得不上书道：“请急如抚臣约，乘冰急进，免使将士因不战而怨。并急罢臣，以正臣摧战士之气，灰任事之心之罪。”意思是说，请皇上马上照巡抚大人的意见办，趁着辽河还未结冰立即进兵，免得将来将士因未能进攻而发牢骚。并立即将臣罢免，追究臣打击战士斗志之罪。
这样一来，经抚之间的矛盾终于表面化了，并发生了激烈冲突。民无二主，军无二帅。明军在辽西的两个统帅，产生了如此激烈的冲突，战败，已经是不可避免的了。而造成这一切的罪魁祸首，正是明国朝廷。
熊廷弼曾经质问王化贞：“防守的工具就是进攻的工具，现在人饥马疲，守都守不住，我们凭什么去进攻？”
王公贞随意的回答：“正因为不能守，所以必须进攻。”
熊廷弼听着这样的疯话，气得浑身乱颤，他接着问：“军马未动，粮草先行，现在粮食的运输及筹集如此艰难，进攻的话，大军的粮食怎么供应？”
王化贞不假思索，口出浪言：“我们一旦打过河，收复了海州，海州的粮食就是我们的粮食。攻下牛庄后，敌人内部定有响应者。”
这纯粹是狗屁话，别说你打不下海州，就是真的打下了，努尔哈赤能留给你粮食吗？一把火将粮仓烧个精光，过河大军喝西北风？性格耿直的熊廷弼，气得大骂王化贞是白痴。在背后，王化贞同样认为熊廷弼是白痴，是没胆鬼。
至此，两人的矛盾，已经是完全不可调和了。于是两人都上书，要求辞职，不再和对方一起共事。这完全是在赌气了。对二人的相继请辞，朝廷专门召开了会议，与会者八十余人，仅有一个人站在熊廷弼一边，其余全是倒熊派，王化贞在政治上完全掌握了主动权。
如果要让张准用一句话来形容熊廷弼，那就是“军事上的奇才，政治上的白痴”。熊廷弼已经有了一次被免官的教训，这次重任经略，应当适当注意一下与朝中百官的关系。毕竟，大家一起共事，是需要互相理解，互相帮助，互相协调的。
但这个人实在是太不可理喻了，他非但没有吸取教训，反而更加暴烈，用至谩骂朝中权贵，不但和王化贞搞得不可开交，和朝中许多手握重权的官员们也是形同水火，以至于事事受朝中掣肘，他的三方布置的战略根本无法得到实施。
