政务院有左丞相荀彧掌管，直接对龙飞负责。下设四部，农事部由益州降将黄权任尚书，协调全国上下的粮食买卖、供给，以及黄历的编撰修订，粮食品种的开发与种植等等；商事部有甄饶任尚书，全国上下所有商业互动全有商事部负责，也包括对外的采购和出口；工事部由马均为尚书，负责基础设施建设，兵器研制开发，战舰的督造等，有关施工和研制；法事部由钟繇负责，监管全国各级官吏以及行政人员，并处理民间纠纷，法事部内配备一支由退役兵卒组成的准军事部门，专门维护内部治安，龙飞将其命名为飞虎队。轻松读出了这四大部门外还有一些独立的小部门，比如王巍的采购部，专门负责采购紧需货物，塔伦的牧部，不但培育耕牛，还培育优良战马。
军务院就更加复杂，因为龙飞是军人出身，对军队的了解更透彻，所以改造起来完全按照现代军队的结构进行调整。贾诩为总军师，协调个军种之间的关系，战时安排作战单位发布作战命令，调配作战人员全都是他的活。郭嘉为军师参谋，专门制定作战计划与作战方针，李儒为军师参谋，负责部队的备战训练与调动，黄月英为军师参谋，负责后勤补给，装备配备。这样做的效果就是更专业，配合起来也更加默契。
在原来四征将军的基础上，龙飞面对整个天下的形势，多大军做了调整。保留四大将军头衔，将全国分为五大军区，东西南北中，每个军区的大将军便如司令员一般，平时训练，战时他们就是统帅。同时将所有军兵进行调整，配备在各个要冲。
赵云为征西大将军，目前下辖凉州、雍州，马超为镇西将军驻守凉州，庞德为洛阳将军驻守洛阳。龙飞明白，统一天下只不过是个开始，西面的陆地何其广大，他的目标远的都很，西域乃是欧洲全都在他的计划之内。
高顺为征南大将军，目前下辖益州和南蛮，张任为镇南将军驻守益州，祝融为南蛮将军，前凸南蛮，为以后南下开始准备。主要动用南蛮军团，配合龙军主力要西上高原，横穿原始森林，彻底将周边的威胁破除。
黄忠为征北大将军，目前下辖宛城及豫州一部，文聘为镇北将军。他们的目标首先是曹操，接下来就是塞外蛮族，龙飞首先透露了一个消息，在蛮族的北面还有广阔的空间，能不能拿下就看他们的本事。文聘镇守宛城多年，早已摁耐不住，向龙飞保证，定要打到天涯海角。
