也就在杨晞当了皇帝的三个月后，大唐朝廷宣布，军制改革全面展开。
这次改革，很重要的一点就是：兵部职权的变革及各镇节度使编制取消。
朝廷的诏令中宣布，依然以兵部为大唐的最高军事机关，全面掌管全国各卫军军籍管理、军官的培养选拔、军队训练及讲武、国防、情报侦探、武器制作、马政、舟桥之务。
全国军队之征讨、镇戍、训练等皆听命于兵部，遇有战事，兵部奉皇帝旨意调军，任命兵马元帅、副元帅及行军大总管和各分总管，发给印信，率领调发的军队出征；战争结束，领兵官缴印于朝，官军各回驻防地。兵部的职司与原来并无太大区别，但其结构组成上却发生了很大的变化。
兵部下面设有七个部门，一为从来没有过的参谋部；二为兵部司；三为军器监；四为新设立的情报司，五曰职方司，六曰驾部司，七曰库部司。
除了参谋部和情报司及单独设立的军器监外，其他部门都是原来兵部所辖的职司部门。
军器监划规兵部管辖，这是必然的趋势。
情报司主管全部的情况侦探工作，包括军事和民生方面，这是一个极其重要的部门，其主管直接对皇帝负责，兵部尚书只是名义上的主管，没有皇帝的授权，不能插手情报司的工作。
参谋部也直接对皇帝负责，他的职权主要包括主掌全国兵马调遣，包括兵马的补充和屯防，更重要的是战时进行战事的布置。参谋司人员组成不固定，日常由几名兵部官员主事处置事务。但是在战时，参谋部将会无限扩大，组成人员可包括朝中任何重要官员。
也就是说，在战时，参谋部将是战争的最高决策机构。
杨晞计划，这样的制度在运行一段时间后，将参谋部从兵部里面独立出来，成为一个直接对皇帝及政事堂负责的部门。以后的兵部，将成为类似后世国防部的部门。
