而朱慈烺思虑再三之后，还是觉得设立藩镇，是目前大明能够使用的最合适的治理殖民地的方法。
要不然还能怎么办？
现在大明朝廷的直辖地盘走得是军政分离的路线，巡抚、知府（州）基本上不能干涉军务（除了维持治安的巡标），而总督、提督、总兵也不能干涉地方政务。
另外，总督、提督、总兵只是军区（战区）的负责人，除非有特旨授权，否则他们不能管辖防区内驻扎的模范师（包括师所辖的部队）和其他由大元帅府直接控制的部队，基本上就只能管辖一些模范团——不是所有未编入师的模范团都由总督、提督、总兵管辖，他们只能管其中的一部分。
此外，征兵和训练新兵以及军眷管理这些事情，还有16个将军府管辖——这些将军府理论上是由大元帅府直辖的。虽然将军一职可以由提督兼任，但是将军府和提督司不能合并，必须保持两套班子。
在这种情况下，大明直辖地盘上的军权、政权都被拆得很细，总督、提督、总兵、巡抚、知府、知州这些高官都只能管自己的一摊，互相牵制，谁也没有全权。
这种治理结构保证了大明中央的权威，但同时也降低了地方军政的效率。
在南京周围一两千里距离内，效率降低的幅度还不大——600里加急三四天能到，那么中央两府（内阁府、大元帅府）就能及时加以处置。
但是超出这个距离，管辖起来就有点吃力了！
