而咒印术，则更像是把基础术式融合起来，通过特定的融合图案，来决定咒印查克拉的特性，且和封印术构建封印空间不同，咒印术直接是通过基础术式的融合图案来产生特定查克拉达到咒印术的目的。而如果构成基础术式查克拉有其特殊性的话，相同术式融合图案也可以产生完全不同的特殊咒印查克拉，从而产生新的咒印术。相比于封印术，咒印术的可变性更强。
可以看得出来，两者在构成方面，就是截然不同的。
其次，是作用方向的不同，封印术，基本上是作用于查克拉，也就是说是针对查克拉的一种术，封印的也基本上都是查克拉，比如你封印忍术，如果是火遁忍术，它封印的就是这个火遁忍术的火属性查克拉转变的火焰，严格意义上来说，还是查克拉方面的东西。
而咒印术则不同，咒印术是直接作用于人体，乃至人体细胞和精神的一种术，能够通过不同图案产生的咒印查克拉，达到不同的限制、控制乃至改变人体的效果。
比如说团藏的根成员舌头上的咒印，就是能够限制被施术者的言语能力，是一种作用于人体精神层面的咒印术，可以防止这被施术者说出关于他的一切情报。
斑在琳和带土心脏上设下的不能自杀的咒印也是同理。
而大蛇丸从重吾身上提取细胞而研制出来的天咒印和地咒印，就是一种能够改变人体的咒印术。
至于这咒印术的修习难度，千叶在看过这可以说是详细到只看一遍就让千叶对咒印术有了一个清晰的大概的卷轴之后，觉得是比封印术稍稍难一些的。
